class: center, middle, inverse, title-slide # Fachartikel publizieren ## Versuch einer Anleitung ###
Sebastian Sauer ### CC-BY-4.0
https://data-se.netlify.com/slides/papers-publizieren/papers-publizieren2.html#1
--- class: center, middle, inverse <style> .remark-slide-number { position: inherit; } .remark-slide-number .progress-bar-container { position: absolute; bottom: 0; height: 4px; display: block; left: 0; right: 0; } .remark-slide-number .progress-bar { height: 100%; background-color: red; } </style> # Überblick --- ## Ihr Paper wurde angenommen <img src="https://media.giphy.com/media/r9WS57qOqU1KU/giphy.gif" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## There's no free lunch <img src="https://i.imgflip.com/2qmhys.jpg" width="50%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Fünf Schritte zur Publikation .center[
] --- class: center, middle, inverse # Schritt 1: Thema finden --- class: top, left ## Man kann nicht alle Papers lesen <img src="papers-publizieren2_files/figure-html/sci-growth-1.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> <small> Bornmann and Mutz (2015); Larsen and von Ins (2010) </small> <!-- Die Literaturmenge verdoppelt sich alle 9 Jahre --> --- ## Wer liest 50 Milllionen Papers? <img src="img/newton.png" width="40%" style="display: block; margin: auto;" /> <!-- ca. 30.000 Journals --> <small> Bildquelle: https://www.buzzfeednews.com/article/alexkasprak/best-science-memes/ </small> --- ## Lesen Sie (nur) zu Ihrem Steckenpferd <img src="https://media.giphy.com/media/3oFzlYqs3jaI90KaL6/giphy.gif" width="100%" style="display: block; margin: auto;" /> [Google Scholar](https://scholar.google.de/ ) ist eine nützliche Suchmaschine. --- ## Nutzen Sie eine Software zur Literaturverwaltung - [Zotero](https://www.zotero.org/) (open source ✌️) - [Mendeley](https://www.mendeley.com/) (zu Elsevier 💰) - [JabRef](http://www.jabref.org/) (kein Word-Plugin 🤓) Es gibt [mehr Zitierstile](https://www.zotero.org/styles), als es Fachzeitschriften gibt... --- ## Zotero .center[ <iframe src="https://www.zotero.org/" width="70%" height="400px"></iframe> ] --- ## Befüllen Sie Ihre Literatur-Datenbank per DOI-Suche <img src="img/zotero-lookup.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Soziale Medien für Wissenschaftler - [Blogs](https://data-se.netlify.com/) - [Twitter](https://twitter.com/) - [Researchgate](https://www.researchgate.net/) - [Medium](https://medium.com/) - [Facebook](hptts://facebook.com/) --- ## Große Unis bieten Zugang zu vielen Papers <img src="img/stabi.png" width="60%" style="display: block; margin: auto;" /> <!-- ## Lesen Sie nach dem Pryamidenprinzip --> <!-- - Titel --> <!-- - Absctract --> <!-- - Überschriften --> <!-- - Diagramme --> <!-- - Informationsdichte Abschnitte --> --- ## Suchen Sie interessante Journals <img src="img/sjr.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> <small> http://www.scimagojr.com/journalrank.php </small> --- ## Trauen Sie keinem Impact Factor <img src="img/brembs_power.jpg" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> Wenig Zusammenhang zwischen IF und statistischer Power <small> @Brembs2013, Abbildung 2, CC-BY </small> --- ## Der Impact Factor sagt wenig über einzelne Papers aus <img src="img/cit_distrib-crop.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> Nature: IF = 38.1, 75% der Artikel unterhalb des IF Science: IF = 34.7, 76% der Artikel unterhalb des IF PLOS ONE: IF = 3.1, 72% der Artikel unterhalb des IF <small> Lariviere, Kiermer, MacCallum, McNutt, Patterson, Pulverer, Swaminathan, Taylor, and Curry (2016a) </small> --- ## Zielen Sie auf Journals mit hohem Impact Factor <img src="img/rejection-rate.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> <small> https://blog.frontiersin.org/2015/12/21/4782/ </small> --- class: center, middle, inverse # Schritt 2: Studie planen --- ## Kochen Sie eine Studie nach *Procedure* Subjects were presented the stimuli on an iMac desktop. Each subject saw all four looks for each of the 25 models in a randomized sequence and rated them for attractiveness, likeability, trustworthiness, and competence using a 7-point "slider scale" ranging from end points labeled "not at all" to "highly/ extremely." Etcoff, Stock, Haley, Vickery, and House (2011) --- ## Melden Sie Ihre Studie an <img src="img/osf_prereg.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> https://osf.io/prereg/ <!-- ## Verringern Sie die Researcher Degrees of Freedom --> --- ## Bedenken Sie Falsch-Positiv-Befunde ``` ## Warning: `data_frame()` is deprecated, use `tibble()`. ## This warning is displayed once per session. ``` <img src="papers-publizieren2_files/figure-html/unnamed-chunk-7-1.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Richtlinien für mehr weniger Falsch-Positiv-Befunde 1. Stichprobengröße vorab festlegen 2. Auf ausreichende Power achten (cell size > 20) 3. Alle Variablen vorab festlegen 4. Studienablauf vorab festlegen <small> Simmons, Nelson, and Simonsohn (2011), [Volltext hier](http://journals.sagepub.com/doi/abs/10.1177/0956797611417632?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%3dpubmed), Wicherts, Veldkamp, Augusteijn, Bakker, van Aert, and van Assen (2016), [Volltext hier](https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpsyg.2016.01832/full) </small> --- ## Berechnen Sie Power (oder Präzision) Ihrer Studie vorab ```r library(pwr) pwr.t.test(n = 30, d = .3) ``` ``` ## ## Two-sample t test power calculation ## ## n = 30 ## d = 0.3 ## sig.level = 0.05 ## power = 0.2078518 ## alternative = two.sided ## ## NOTE: n is number in *each* group ``` --- ## Effektstärken der freien Wildbahn sind klein - klein (25. Perzentil): `\(\rho = 0.1\)` - mittel (50 Perzentil): `\(\rho = 0.2\)` - groß (75. Perzentil): `\(\rho = 0.3\)` <small> Gignac and Szodorai (2016) </small> --- ## Denken Sie an Datenschutz und sonstige Ethikbelange > Wenn Daten vollständig anonymisiert sind, z.B. Fragebogendaten oder Daten aus Experimentalreihen, muss eine entsprechende Einwilligung nicht notwendigerweise eingeholt werden, da keine individuellen Zuordnungen mehr möglich sind. In begründeten Zweifelsfällen sollte die lokale Ethikkommission bzw. die Ethikkommission der DGPs konsultiert werden <small> Schönbrodt, Gollwitzer, and Abele-Brehm (2016) </small> --- ## Arbeiten Sie mit Kollegen und Studierenden zusammen <img src="https://imgs.xkcd.com/comics/interdisciplinary.png" width="50%" style="display: block; margin: auto;" /> <small> https://xkcd.com/755/ </small> --- class: center, middle, inverse # Schritt 3: Daten auswerten --- ## Mit Excel sind Fehler schwer zu finden <img src="img/excel1.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> Herndon, Ash, and Pollin (2013) --- ## Das Problem ist, dass Excel Daten und Analyse vermengt. <img src="img/excel2.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Bauen Sie keine komplexen Excel-Tabellen <img src="https://imgs.xkcd.com/comics/algorithms.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Nutzen Sie Syntaxsprachen wie R Auf Deutsch: ```r nimm meine_rohdaten und dann ... lies_sie_ein() und dann ... entferne_fehlende_Werte() und dann ... gruppiere_nach(geschlecht) und dann ... berechne(umsatz_mw = mittel(umsatz)) speichere als meine_daten ``` <br> <br> Auf Errisch: ```r my_rawdata %>% read_csv() %>% drop_na() %>% group_by(sex) %>% summarise(umsatz_mw = mean(umsatz)) -> my_data ``` --- ## Rücken Sie Diagramme ins Zentrum Ihrer Analyse <img src="img/circlize.png" width="50%" style="display: block; margin: auto;" /> <small> http://zuguang.de/circlize/ </small> --- ## Rücken Sie Diagramme ins Zentrum Ihrer Analyse 2 <img src="img/nuts.png" width="50%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Lesen Sie ein R-Buch <img src="https://images.springer.com/sgw/books/medium/9783658215866.jpg" width="30%" style="display: block; margin: auto;" /> --- class: center, middle, inverse # Schritt 4: Manuskript schreiben --- ## Kopieren Sie die alten Meister <img src="http://library.uthscsa.edu/wp-content/uploads/2012/03/Durer6.jpg" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Vermeiden Sie Ablenkungen .center[ <iframe src="https://blank.org/" width="70%" height="400px"></iframe> ] --- ## Schreiben Sie im Häusle-Bauer-Stil | Häusle-Bauer | Paper-Schreiber | |-----------------|-----------------| |
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| | Entwurf | Notizen | | Plan | Gliederung | | Rohbau | Stichpunkte | | Innenausbau | Ausformulieren | | Verputzen | Formatieren | | Einziehen! | Einreichen! | --- ## Machen Sie Notizen, bevor Sie Folien malen <img src="img/scribble.jpg" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Schicken Sie das Manuskript NICHT per MAil <img src="img/email1-crop.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Nutzen Sie eine gemeinsame Datei-Ablage <img src="img/server-crop.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- background-image: url(https://github.com/yihui/xaringan/releases/download/v0.0.2/karl-moustache.jpg) --- ## Schreiben Sie mit Rmarkdown <iframe src="https://player.vimeo.com/video/178485416" width="700" height="394" frameborder="0" style="margin-bottom: 2em;" webkitallowfullscreen mozallowfullscreen allowfullscreen> </iframe> https://github.com/rstudio/rmarkdown --- ## Dateien versionieren - kann helfen <img src="https://imgs.xkcd.com/comics/documents.png" width="40%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Versionieren Sie mit `git` <img src="https://cdn-images-1.medium.com/max/1600/0*Xokg4oWGLB96vhyW." width="50%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Git hilft, Änderungen im Text zu dokumentieren <img src="https://cdn-images-1.medium.com/max/1600/1*Ww0myq8v2Ot3pqaptPBt1Q.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Titel: prägnant und ansprechend > "You probably think this paper's about you: narcissists' perceptions of their personality and reputation." --- ## Der Abstract ist das Aushängeschild <img src="img/tweet.png" width="60%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Markdown http://markdownlivepreview.com/ <!-- https://jbt.github.io/markdown-editor/ --> <!-- https://dillinger.io/ --> <!-- http://markdown.pioul.fr/ --> --- ## Template `papaja` für APA-Formatierung ```r devtools::install_github("crsh/papaja") ``` [RMarkdown-Datei](https://raw.githubusercontent.com/crsh/papaja/master/example/example.Rmd) [PDF-Ausgabe](https://raw.githubusercontent.com/crsh/papaja/master/example/example.pdf) https://github.com/crsh/papaja --- ## Fügen Sie die 21-Word-Lösung hinzu > We report how we determined our sample size, all data exclusions (if any), all manipulations, and all measures in the study. <small> Simmons, Nelson, and Simonsohn (2012) </small> --- class: center, middle, inverse # Schritt 5: Manuskript einreichen --- ## Erstellen Sie sich eine ORCID
> ORCID provides a persistent digital identifier that distinguishes you from every other researcher and, through integration in key research workflows such as manuscript and grant submission, supports automated linkages between you and your professional activities ensuring that your work is recognized. https://orcid.org/ --- ## Beurteilen Sie die Qualität Ihres Manuskripts - [STROBE (Beobachtungsstudien, z.B. Korrelation)](https://www.strobe-statement.org/index.php?id=available-checklists) - [CONSORT (Experimentelle Studien)](http://www.consort-statement.org/checklists/view/32--consort-2010/66-title) --- ## Laden Sie Ihren Preprint auf einen Open Access Server <img src="img/osf_preprints.png" width="60%" style="display: block; margin: auto;" /> --- ## Machen Sie Ihre Daten und Ihr weiteres Material zugänglich <img src="img/opendata.png" width="20%" style="display: block; margin: auto;" /><img src="img/openmaterials.png" width="20%" style="display: block; margin: auto;" /> Beispiel: [Datensatz zu Extraversion](https://osf.io/4kgzh/) --- ## Nutzen Sie das Open Science Framework
(OSF) <img src="img/osf.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> https://osf.io/ --- ## Schreiben Sie in den sozialen Netzwerken <iframe src="https://data-se.netlify.com/" width="70%" height="400px"></iframe> --- ## Klären Sie, wer Autor ist Autoren sollen vier Kriterien erfüllen: 1. Substanziell beitragen zur Entwicklung der Studie oder Datenerhebung oder Datenanalyse oder Interpretation der Ergebnisse UND 2. Das Manuskript (in Teilen) schreiben oder kritisch revidieren UND 3. Der finalen (zu publizierenden Version) explizit zustimmen UND 4. Zustimmen, für alle Aspekte der Publikation verantwortlich zu sein (hinsichtlich Integrität, Richtigkeit, Genauigkeit etc.) Ansonsten *acknowledgement* <small> http://www.icmje.org/recommendations/browse/roles-and-responsibilities/defining-the-role-of-authors-and-contributors.html </small> --- ## Schauen Sie Ihren h-Index nach (bei Google Scholar) <img src="img/H-index-en.svg" width="50%" style="display: block; margin: auto;" /> <small> H-index. (2018, January 24). In Wikipedia, The Free Encyclopedia. Retrieved 12:08, January 25, 2018, from https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=H-index&oldid=822182293 </small> --- ## Erstellen Sie sich ein Google-Scholar-Profil <img src="img/ses_scholar.png" width="70%" style="display: block; margin: auto;" /> https://scholar.google.de/ --- ## Ertragen Sie die Hinweise der Reviewer > The manuscript reads much like an unrevised masters level paper. > You do not use the empirical data for the analysis, but the empirical data uses you. <!-- > The author does not exhibit adequate acquaintance with the subject under discussion, the scholarship on it, the structure of logical argument, or the writing of English. --> > This article is on an interesting topic. Unfortunately there is no more positive to say about this manuscript. <small> https://shitmyreviewerssay.tumblr.com/ </small> --- class: center, middle, inverse # Zusammenfassung --- background-image: url("http://bit.ly/cs631-donkey") background-size: cover --- class: center, middle, inverse # Anhang --- ## Danke für Ihre Aufmerksamkeit Sebastian Sauer ####
[sebastiansauer](https://github.com/sebastiansauer) ####
<https://data-se.netlify.com/> ####
ssauer@posteo.de ####
[Sebastian Sauer](https://www.linkedin.com/in/dr-sebastian-sauer-4791762) ####
Get html-slides here: <https://data-se.netlify.com/slides/papers-publizieren/papers-publizieren2.html#1> ####
Get pdf-slides here: <https://data-se.netlify.com/slides/papers-publizieren/Fachartikel-publizieren.pdf> --- ## Empfohlene Literatur 1. The Seven Deadly Sins of Psychology, Chambers (2017) 2. How to be a Modern Scientist, Leek (2016) 3. R für Data Science, Wickham and Grolemund (2017) 4. Modern Datenanalyse mit R 🤓 --- ## Zitierte Literatur <P ALIGN=LEFT> <font size="1"> [1] L. Bornmann and R. Mutz. "Growth rates of modern science: A bibliometric analysis based on the number of publications and cited references". In: _Journal of the Association for Information Science and Technology_ 66.11 (2015), pp. 2215-2222. DOI: [10.1002/asi.23329](https://doi.org/10.1002/asi.23329). [2] C. Chambers. _The Seven Deadly Sins of Psychology: A Manifesto for Reforming the Culture of Scientific Practice_. Princeton University Press, 2017. ISBN: 9781400884940. URL: [https://ebookcentral.proquest.com/lib/gbv/detail.action?docID=4843952](https://ebookcentral.proquest.com/lib/gbv/detail.action?docID=4843952). [3] N. L. Etcoff, S. Stock, L. E. Haley, et al. "Cosmetics as a feature of the extended human phenotype: Modulation of the perception of biologically important facial signals". In: _PLoS ONE_ 6.10 (2011), pp. 1-9. ISSN: 19326203. DOI: [10.1371/journal.pone.0025656](https://doi.org/10.1371/journal.pone.0025656). [4] G. E. Gignac and E. T. Szodorai. "Effect size guidelines for individual differences researchers". In: _Personality and individual differences_ 102 (2016), pp. 74-78. [5] T. Herndon, M. Ash and R. Pollin. "Does High Public Debt Consistently Stifle Economic Growth? A Critique of Reinhart and Rogoff.'' Political Economy Research Institute Working Paper No". In: _University of Massachusetts Amherst_ (Apr. 2013). DOI: [https://www.peri.umass.edu/publication/item/526-does-high-public-debt-consistently-stifle-economic-growth-a-critique-of-reinhart-and-rogo-ff](https://doi.org/https://www.peri.umass.edu/publication/item/526-does-high-public-debt-consistently-stifle-economic-growth-a-critique-of-reinhart-and-rogo-ff). [6] V. Lariviere, V. Kiermer, C. J. MacCallum, et al. "A simple proposal for the publication of journal citation distributions". In: _Biorxiv_ (2016), p. 062109. [7] P. O. Larsen and M. von Ins. "The rate of growth in scientific publication and the decline in coverage provided by Science Citation Index". In: _Scientometrics_ 84.3 (Sep. 2010), pp. 575-603. DOI: [10.1007/s11192-010-0202-z](https://doi.org/10.1007/s11192-010-0202-z). [8] J. Leek. _How to be a modern scientist_. Victoria, British Columbia, Canada: Leanpub, 2016. [9] F. Schönbrodt, M. Gollwitzer and A. Abele-Brehm. _Der Umgang mit Forschungsdaten im Fach Psychologie: Konkretisierung der DFG-Leitlinien_. Tech. rep. Deutsche Gesellschaft für Psychologie, 2016. DOI: [https://www.dgps.de/index.php?id=143&tx_ttnews [10] J. P. Simmons, L. D. Nelson and U. Simonsohn. "A 21 word solution". In: _SPSP Dialogue_ (2012), pp. 1-4. ISSN: 1556-5068. DOI: [10.2139/ssrn.2160588](https://doi.org/10.2139/ssrn.2160588). [11] J. P. Simmons, L. D. Nelson and U. Simonsohn. "False-Positive Psychology: Undisclosed Flexibility in Data Collection and Analysis Allows Presenting Anything as Significant". In: _Psychological Science_ 22.11 (Nov. 2011), pp. 1359-1366. ISSN: 0956-7976. DOI: [10.1177/0956797611417632](https://doi.org/10.1177/0956797611417632). eprint: 2021. URL: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22006061](http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22006061). [12] J. M. Wicherts, C. L. S. Veldkamp, H. E. M. Augusteijn, et al. "Degrees of Freedom in Planning, Running, Analyzing, and Reporting Psychological Studies: A Checklist to Avoid p-Hacking". In: _Front Psychol_ 7 (2016), p. 1832. DOI: [10.3389/fpsyg.2016.01832](https://doi.org/10.3389/fpsyg.2016.01832). [13] H. Wickham and G. Grolemund. _R für Data Science_. Sebastopol, CA: O'Reilly, 2017. ISBN: 3960090501. </P> --- ## Technical details - Date: 2019-01-08 - Slides built with `xaringan`, based on `rmarkdown` - Packages: assertthat 0.2.0, backports 1.1.2, bibtex 0.4.2, brew 1.0-6, broom 0.5.0, cellranger 1.1.0, cli 1.0.1, codetools 0.2-15, colorspace 1.3-2, crayon 1.3.4, data.table 1.11.8, DiagrammeR 1.0.0, digest 0.6.18, downloader 0.4, dplyr 0.8.0.9000, emo 0.0.0.9000, evaluate 0.12, forcats 0.3.0, ggdendro 0.1-20, ggformula 0.9.0, ggplot2 3.1.0, ggrepel 0.8.0, ggstance 0.3.1, glue 1.3.0.9000, gridExtra 2.3, gtable 0.2.0, haven 2.0.0, highr 0.7, hms 0.4.2, htmltools 0.3.6, htmlwidgets 1.3, httr 1.3.1, icon 0.1.0, igraph 1.2.2, influenceR 0.1.0, jsonlite 1.5, knitr 1.20, labeling 0.3, lattice 0.20-35, lazyeval 0.2.1, lubridate 1.7.4, magrittr 1.5, MASS 7.3-50, Matrix 1.2-14, modelr 0.1.2, mosaic 1.4.0, mosaicCore 0.6.0, mosaicData 0.17.0, munsell 0.5.0, nlme 3.1-137, pillar 1.3.1, pkgconfig 2.0.2, plotly 4.8.0, plyr 1.8.4, purrr 0.2.5, pwr 1.2-2, R6 2.3.0, RColorBrewer 1.1-2, Rcpp 1.0.0, readr 1.2.1, readxl 1.1.0, RefManageR 1.2.0, rgexf 0.15.3, rlang 0.3.0.1, rmarkdown 1.10, Rook 1.1-1, rprojroot 1.3-2, rstudioapi 0.8, rvest 0.3.2, scales 1.0.0, sessioninfo 1.1.1.9000, stringi 1.2.4, stringr 1.3.1, tibble 2.0.0, tidyr 0.8.2, tidyselect 0.2.5, tidyverse 1.2.1, viridis 0.5.1, viridisLite 0.3.0, visNetwork 2.0.4, withr 2.1.2, xaringan 0.8.1, xaringanthemer 0.2.0, xfun 0.4, XML 3.98-1.16, xml2 1.2.0, yaml 2.2.0 - For detailed `session_info()` check out this [text file](https://data-se.netlify.com/slides/papers-publizieren/session_info.txt). - Thanks for all open source developers.